使用microRNA生物標(biāo)志物的新策略可以區(qū)分黑色素瘤和痣

費城，2019年9月30日——黑色素瘤是最不常見但最致命的皮膚癌之一。它只占世界上所有病例的1%，但大多數(shù)皮膚癌都會死亡。皮膚黑色素瘤的準(zhǔn)確、及時和可靠的診斷仍然是皮膚病理學(xué)的主要挑戰(zhàn)。研究人員在Elsevier出版的《皮膚病學(xué)研究雜志》上報道了一種新的策略，即使用microRNA (mirna)生物標(biāo)志物來檢測皮膚腫瘤中的黑色素瘤細(xì)胞，即使腫瘤主要包含良性細(xì)胞。

首席研究員Robert L. Judson-Torres博士解釋說：“雖然皮膚黑色素瘤可以通過早期發(fā)現(xiàn)治愈，但區(qū)分惡性病變和更常見的良性病變(如黑色素細(xì)胞痣)的過程具有挑戰(zhàn)性。”加利福尼亞州舊金山(UCSF)，目前在美國猶他州鹽湖城猶他大學(xué)亨斯邁癌癥研究所和皮膚科工作?！罢麄€皮膚病理科和護理中心的不合格率都很高。因此，能否早期準(zhǔn)確診斷患者，取決于患者的居住地。”

分子生物標(biāo)志物(如miRNA)是診斷包括黑色素瘤在內(nèi)的許多疾病的潛在有價值的候選生物標(biāo)志物。然而，盡管已經(jīng)確定了與良性黑色素細(xì)胞病相比黑色素瘤中數(shù)百種差異表達(dá)的miRNA，但研究中有限的共識限制了它們的有效使用。

根據(jù)Judson-Torres博士和合作研究人員的說法，分子方法在黑色素瘤診斷中的優(yōu)勢之一是可以進行真正客觀的檢測——無論是誰進行測量，都可以生成并復(fù)制準(zhǔn)確的診斷分?jǐn)?shù)。然而，基于基因表達(dá)的分子方法容易被腫瘤和組織異質(zhì)性所混淆。他們報告了克服這一障礙的新策略。

在這項研究中，研究人員使用機器學(xué)習(xí)來識別miRNA，這是一種可以連續(xù)診斷惡性黑色素瘤和良性痣的分子。首先，他們確定腫瘤的異質(zhì)性和患者的年齡是最常混淆基于miRNA的黑色素瘤診斷方法的變量。第三，他們使用機器學(xué)習(xí)方法來確定可以預(yù)測和診斷而不受這些變量影響的miRNA的表達(dá)比例。他們評估了來自舊金山加州大學(xué)皮膚科檔案的82例黑色素細(xì)胞病變活檢。這些病變有已知的結(jié)果(41例診斷為痣，41例診斷為黑色素瘤)。使用這種新方法，病變的敏感性和特異性分別為81%和88%，結(jié)果不受樣本中腫瘤含量或患者年齡的影響。

該研究的主要作者羅德里戈托雷斯(Rodrigo Torres)博士說：“我們發(fā)現(xiàn)，通過開發(fā)基于診斷上重要的miRNA比率的分類器，我們可以提供更強大的生物標(biāo)志物，這些生物標(biāo)志物不容易受到腫瘤細(xì)胞含量和平臺變化的影響，因此可以用于更多種類的患者樣本。

大量研究分析了mirna在黑色素瘤不同發(fā)展階段的表達(dá)，已鑒定出500多種富含痣或黑色素瘤的mirna，其中大部分尚未被外部驗證集復(fù)制。Judson-Torres博士和他的同事可以將這個廣泛的列表改進為六個miRNA，這可以在獨立的數(shù)據(jù)集和分析平臺上區(qū)分痣和黑色素瘤的再現(xiàn)性。他們可以進一步利用這些發(fā)現(xiàn)來確定八種可以預(yù)測和診斷而不受其他混雜變量影響的miRNA的比例。需要進一步的研究來確定這種方法在模糊情況下的準(zhǔn)確性，以及它是否可以預(yù)測轉(zhuǎn)移或總生存率。

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