一種新的篩選方法可以檢測直接的生物分子相互作用
研究人員開發(fā)了一種新的高通量篩選方法來檢測直接的生物分子相互作用。需要這種篩選技術(shù)來揭示細(xì)胞構(gòu)件是如何連接的,這對于理解細(xì)胞在疾病中的功能或作用非常重要。這種方法被設(shè)計得既便宜又可行,這使得它適用于每個標(biāo)準(zhǔn)的生物醫(yī)學(xué)研究實驗室。
是蛋白質(zhì)細(xì)胞的基石。他們做大部分工作,這對細(xì)胞和身體組織器官的結(jié)構(gòu)、功能和動態(tài)調(diào)節(jié)至關(guān)重要。蛋白質(zhì)很少單獨(dú)起作用。它們相互作用形成蛋白質(zhì)復(fù)合物或結(jié)合DNA和RNA來控制細(xì)胞的功能。這些復(fù)合物是細(xì)胞中許多重要反應(yīng)的關(guān)鍵部分,如能量代謝或基因調(diào)節(jié)。這些相互作用的任何變化(例如,它可能是由突變引起的)都可以改變健康和疾病。因此,為了了解細(xì)胞是如何工作的,或者細(xì)胞中可能會出現(xiàn)什么問題,了解它們的構(gòu)件如何相互作用是非常重要的。
新技術(shù)使科學(xué)家能夠了解生物在過去幾十年中的遺傳信息,哪些信息被積極利用,哪些蛋白質(zhì)是由細(xì)胞在不同條件下制造的?,F(xiàn)在,理解蛋白質(zhì)和核糖核酸信使分子等生物分子如何結(jié)合形成功能細(xì)胞所需的復(fù)合物是一個巨大的挑戰(zhàn)。換句話說,我們知道細(xì)胞結(jié)構(gòu)的成千上萬個部分,但我們不知道它們是如何結(jié)合的。
在《自然通訊》上發(fā)表的一篇論文中,來自基因組調(diào)控中心(CRG)的科學(xué)家描述了一種稱為“rec-YnH”的新方法的發(fā)展,該方法旨在了解數(shù)百種蛋白質(zhì)和核糖核酸之間形成的復(fù)合物。時間到了。
這種方法是由塞巴斯蒂安莫伊雷爾與路易斯塞拉諾實驗室合作開發(fā)的。這是第一項允許同時檢測大量蛋白質(zhì)和核糖核酸分子之間相互作用的技術(shù)。研究人員強(qiáng)調(diào)開發(fā)一種可行的、經(jīng)濟(jì)的、廣泛適用的方法。
Sebastian Maurer解釋說:“我們的方法可靠地測量了許多蛋白質(zhì)或許多蛋白質(zhì)和RNA片段之間的相互作用,而無需昂貴的特殊設(shè)備?!斑@種方法可以被任何標(biāo)準(zhǔn)的生物醫(yī)學(xué)研究實驗室使用,對于研究細(xì)胞中的特定過程也很有用。同時,這也是一種方法,研究人員必須一次探索數(shù)百萬種蛋白質(zhì)相互作用,以找到與特定疾病相關(guān)的化合物,”他總結(jié)道。
兩個CRG實驗室成功地結(jié)合了他們在生物信息學(xué)、生物化學(xué)和分子生物學(xué)方面的專業(yè)知識來實施和驗證這種方法。“我們的合作產(chǎn)生了一種經(jīng)濟(jì)可行的方法,可以生成高質(zhì)量的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)-RNA相互作用的圖譜,”博士后研究員、這篇論文的共同第一作者楊在成說。
“蛋白質(zhì)和RNA之間的相互作用是許多生物過程的關(guān)鍵,包括基因調(diào)控。我們的方法是第一個可以同時檢測數(shù)百種蛋白質(zhì)和核糖核酸之間相互作用的方法。擁有如此高效的新工具對于回答與許多疾病相關(guān)的重要問題非常重要,”該研究的第一作者、CRG研究員米雷婭加里加說。
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