人類免疫學數(shù)據和工具的新開放訪問門戶

艾倫免疫學研究所的研究人員一直很忙。自艾倫研究所分部于 2018 年底成立以來，由免疫學家、分子和計算生物學家、工程師和其他工作人員組成的 60 人團隊一直在建立一種新的研究方式來處理大量數(shù)據通過實驗和分析的方式：長期研究免疫系統(tǒng)在人類健康生活過程中或免疫相關疾病期間如何變化、反應或無反應。

現(xiàn)在，該部門為所有人建立了一個新的在線門戶網站，以探索他們的工作細節(jié)，并最終探索與健康和疾病相關的人類數(shù)據。

今天推出的人類免疫系統(tǒng)資源管理器是艾倫免疫學研究所面向更廣泛社區(qū)的數(shù)據共享門戶。該網站使用去識別和匿名數(shù)據構建，允許科學家深入研究免疫學團隊用于分析和管理其人類免疫學研究的方法和資源。隨著該團隊對免疫健康和疾病的長期研究完成，這些數(shù)據也將存儲在公共門戶上。研究人員希望通過向公眾公開他們的數(shù)據，科學界的其他人將梳理這些數(shù)據，以對人類免疫學提出自己的見解，最終可能為免疫相關疾病帶來更好、更精確的療法。

隨著免疫學團隊建立了一個專門的流程，也稱為研究管道，以開展對人類免疫健康和疾病的多年研究，包括對 、癌癥和自身免疫性疾病的免疫系統(tǒng)研究，他們意識到他們需要開發(fā)新的方法來研究免疫系統(tǒng)并分析結果數(shù)據。由于他們繼續(xù)跟蹤健康和患者志愿者兩年或更長時間，開放訪問平臺上的第一個公開版本包含與這些新開發(fā)的方法相關的數(shù)據和工具。長期研究本身的數(shù)據將在未來幾年在公共門戶網站上發(fā)布。

第一個公開版本包括：

描述該團隊研究流程的協(xié)議，該流程除了臨床數(shù)據外，還隨時間從同一個人身上捕獲并整合了五種不同類型的人體免疫系統(tǒng)分子數(shù)據

一種名為 TEA-seq 的新方法和隨附的數(shù)據可視化應用程序，可同時從單個人體免疫細胞中捕獲三種類型的數(shù)據：細胞表面存在的蛋白質;在每個細胞中開啟或表達的一組基因;以及細胞的“表觀遺傳”景觀，它提供了有關其基因如何被調節(jié)的線索

數(shù)據和伴隨的交互式可視化團隊發(fā)現(xiàn)延遲處理人類血液樣本會改變免疫細胞的某些分子特性(這一發(fā)現(xiàn)導致團隊及其外部合作者在從研究志愿者身上采集血液樣本后標準化快速處理血液樣本)

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