尼羅河大鼠的高質(zhì)量參考基因組組裝有助于糖尿病研究

模式生物對(duì)于生物醫(yī)學(xué)研究至關(guān)重要，并促成了許多重要的科學(xué)發(fā)現(xiàn)。對(duì)這些模型的基因組進(jìn)行測(cè)序的能力是研究影響人類健康的遺傳因素的有力工具。

家鼠(Mus musculus) 和挪威大鼠 (Rattus norvegicus) 由于與人類的遺傳相似性而被廣泛用于研究。但是另一只嚙齒動(dòng)物正在崛起——;Arvicanthis niloticus，尼羅河鼠。

今天發(fā)表在BMC Biology上的新研究為尼羅河大鼠提供了高質(zhì)量的參考基因組組裝，擴(kuò)大了其作為模式生物的潛力。

我們需要研究工具，使我們能夠?qū)δ崃_河大鼠做同樣的事情，就像我們過去對(duì)實(shí)驗(yàn)室老鼠所做的那樣。擁有參考基因組是朝著這個(gè)目標(biāo)邁進(jìn)的一步。”

Yury Bukhman，Morgridge 斯圖爾特計(jì)算生物學(xué)小組的計(jì)算生物學(xué)家，該項(xiàng)目的資深作者

特別是，在實(shí)驗(yàn)室小鼠和大鼠存在局限性的兩個(gè)研究領(lǐng)域中，尼羅河大鼠可作為替代模型。2 型糖尿病和與晝夜節(jié)律紊亂相關(guān)的疾病。

小鼠和大鼠是夜行動(dòng)物，因此它們?cè)谀M人類晝夜周期方面的價(jià)值較低。此外，他們可以通過高脂肪飲食出現(xiàn)糖尿病前期癥狀，但很少會(huì)出現(xiàn)像患有這種疾病的人類那樣的長期糖尿病并發(fā)癥。

“你可以改變它們的基因，你可以給它們大量的脂肪，或者使用化學(xué)物質(zhì)來加速這個(gè)過程。但這是你正在推動(dòng)動(dòng)物模型以獲得你想要的東西的許多額外的混雜因素，”第一作者說Huishi Toh 是加州大學(xué)圣塔芭芭拉分校的助理項(xiàng)目科學(xué)家，曾與 Morgridge 再生生物學(xué)名譽(yù)主任、UCSB 教授 Jamie Thomson 一起工作。

尼羅河鼠是晝夜活動(dòng)的，在白天像人類一樣活躍。然而，與夜間活動(dòng)的嚙齒動(dòng)物相比，它的眼睛中也有更多的光感受器，這使得它與研究人類視網(wǎng)膜疾病有關(guān)——;包括糖尿病視網(wǎng)膜病變。

“在 2 型糖尿病中仍有很多發(fā)現(xiàn)的空間，問題難以回答。這就是為什么我們認(rèn)為也許是時(shí)候在新的動(dòng)物模型上冒險(xiǎn)了，”Toh 說。“這是否意味著它更準(zhǔn)確，或者您可以替換其他模型?不，當(dāng)然不是。但是您也可以找到有用的不同信息。”

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