eDNA 測序?qū)⑹箍茖W(xué)家能夠在不捕魚的情況下探索亞馬遜地區(qū)的魚類多樣性

在巴西、哥倫比亞和秘魯邊界的 Javari 河流域進(jìn)行的一次科學(xué)考察表明，使用環(huán)境 DNA 測序來調(diào)查亞馬遜地區(qū)的魚類多樣性是可行的。eDNA 方法包括提取水樣中存在的 DNA 分子并通過遺傳標(biāo)記識別它們所屬的物種。

發(fā)表在《科學(xué)報(bào)告》雜志上的一篇關(guān)于這項(xiàng)研究的文章還討論了該技術(shù)在研究亞馬遜河這樣高度多樣化的環(huán)境方面的局限性。

“我們需要繼續(xù)通過傳統(tǒng)方法捕捉和識別動物，以創(chuàng)建遺傳材料庫。它們將作為比較水樣中發(fā)現(xiàn)的任何物質(zhì)的參考。美國史密森學(xué)會國家自然歷史博物館的研究助理卡洛斯·大衛(wèi)·德桑塔納說，隨著技術(shù)的進(jìn)步，幾年后我們可能無需捕捉就能了解一個地方存在的所有魚類。州和文章的第一作者。

這項(xiàng)研究是該項(xiàng)目的一部分，“多樣性和電鰻目的進(jìn)化”，由FAPESP支持和領(lǐng)導(dǎo)Naércio梅內(nèi)塞斯在圣保羅動物博物館(MZ-USP)在巴西的大學(xué)教授。“從水樣中提取 DNA 產(chǎn)生了非常有利于保護(hù)環(huán)境的期望，因?yàn)槭占鷦游飿颖镜某Ｓ梅椒òㄊ褂镁W(wǎng)和其他具有負(fù)面影響的漁具，”梅內(nèi)塞斯說， ——文章作者。

這組研究人員在 Javari 河上度過了 18 天，在他們收集魚類標(biāo)本的 46 個地點(diǎn)中的三個地點(diǎn)收集水樣。所代表的物種數(shù)量達(dá)到了驚人的 443 個，其中 60 個是科學(xué)上的新物種。

在收集用于 eDNA 分析的水的地點(diǎn)，使用傳統(tǒng)方法捕獲了 201 個物種。然而，只有 58 個，即總數(shù)的 26%，通過 eDNA 分析在物種水平上得到了精確鑒定。

“一個可能的解釋是數(shù)據(jù)庫中缺乏可用于比較的參考遺傳材料。此外，這些地方的許多物種都是全新的，在使用傳統(tǒng)技術(shù)之前從未被發(fā)現(xiàn)，”圣保羅聯(lián)邦大學(xué)海洋科學(xué)研究所 (IMAR-UNIFESP) 教授Gislene Torrente-Vilara 說，文章的共同作者。

Torrente-Vilara 作為亞馬遜魚類項(xiàng)目的一部分領(lǐng)導(dǎo)了這次探險(xiǎn)，這是一項(xiàng)由 FAPESP 支持的國際合作，導(dǎo)致對該地區(qū)魚類分布的新認(rèn)識(更多信息見：agencia.fapesp.br/31956)。

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