來(lái)自加利福尼亞州斯坦福大學(xué)的 Yiran E. Liu 及其同事整合了 11 個(gè)公共數(shù)據(jù)集，對(duì)來(lái)自 7 個(gè)國(guó)家的 365 名登革熱患者的血液轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了分析。在非重癥患者和進(jìn)展為 SD 的患者之間鑒定出差異表達(dá)基因(DEG)。XGBoost 機(jī)器學(xué)習(xí)模型僅使用這些 DEG 對(duì)公共數(shù)據(jù)進(jìn)行訓(xùn)練，以預(yù)測(cè)向 SD 的進(jìn)展。該模型在哥倫比亞的 377 名登革熱患者的前瞻性登記隊(duì)列中得到驗(yàn)證。
研究人員在公共數(shù)據(jù)集中確定了八個(gè)與 SD 相關(guān)的 DEG，并建立了一個(gè)八基因 XGBoost 模型。在獨(dú)立驗(yàn)證隊(duì)列中，該模型準(zhǔn)確預(yù)測(cè) SD 進(jìn)展，敏感性和特異性分別為 86.4% 和 79.7%。鑒于隊(duì)列中 SD 病例的比例為 5.8%，八基因模型的陽(yáng)性和陰性預(yù)測(cè)值分別為 20.9% 和 99.0%。臨床預(yù)警信號(hào)的敏感性和特異性分別為 77.3% 和 39.7%;相比之下，八基因模型導(dǎo)致需要預(yù)測(cè)的數(shù)量減少了 80%(從 25.4 減少到 5.0)。八基因模型在發(fā)熱后的前三天和 SD 進(jìn)展前三天提供了對(duì)后續(xù) SD 的準(zhǔn)確預(yù)測(cè)。
一位合著者在一份聲明中說(shuō)： “擁有一種能夠有效預(yù)測(cè)哪些患者將發(fā)展為嚴(yán)重登革熱的生物標(biāo)志物也將有助于選擇登革熱患者進(jìn)行旨在評(píng)估抗病毒策略的臨床研究。”
幾位作者披露了與生物制藥行業(yè)的財(cái)務(wù)聯(lián)系;一位作者擁有專(zhuān)利，并且八基因組已被披露以獲得可能的專(zhuān)利保護(hù)。
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